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基因組重編碼生物體“赭石”誕生

2025年02月14日08:56 | 來源:科技日報
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原標題:基因組重編碼生物體“赭石”誕生

科技日報北京2月13日電 (記者張夢然)美國耶魯大學合成生物學家創建了一種新型基因組重新編碼生物體(GRO),並命名為“赭石”(Ochre),實現了對生物體遺傳密碼的重寫。這一成果發表在最新一期《自然》雜志上,不僅促進了人類對遺傳密碼可塑性的理解,也為未來合成生物學的應用提供了更多可能。

在這項研究中,科學家成功將DNA或RNA中的冗余密碼子壓縮成單一密碼子。密碼子用於指導特定氨基酸的加入或指示蛋白質合成的終止。具體來說,密碼子是DNA和RNA中由3個核苷酸組成的序列,它在蛋白質合成過程中起到“說明書”的作用,指示細胞將20種天然氨基酸中的某一種添加到正在增長的蛋白質鏈中。此外,存在3種“終止密碼子”:TAG、TGA和TAA,它們標志著蛋白質合成的結束。

此次,科學家消除了大腸杆菌中用於終止蛋白質合成的3個“終止密碼子”中的兩個,並重新分配了密碼子的功能,使非標准氨基酸能夠被編碼進蛋白質中。

這項突破性工作,基於超過1000次精確編輯的全基因組工程,其規模比以往任何同類工程都要大一個數量級。此外,科學家還利用人工智能(AI)技術,設計並改良了必需的蛋白質和RNA翻譯因子,創造了一種可以使用兩種非標准氨基酸的新菌株。這些非標准氨基酸賦予蛋白質新的特性,如降低免疫原性或增強導電性,從而為可編程生物治療藥物和生物材料的發展開辟了新途徑。

“赭石”的創建,是向構建具有非冗余遺傳密碼大腸杆菌邁出的重要一步,它特別適合生產含有多種不同合成氨基酸的蛋白質。同時,通過這種技術生產的合成蛋白質,對於醫療和工業應用均擁有巨大潛力。

“赭石”的誕生,無疑標志著合成生物學進入了一個新時代。它顯著推動了我們對遺傳密碼的理解。這種理解為探索新的生物學功能開辟了道路,例如設計特定功能的蛋白質、降低免疫原性研究等,都將極大促進個性化醫療的發展。此外,在工業上,該技術也有望帶來更高效、環保的生物制造方法。不過,我們也要看到這一進步背后的倫理與技術挑戰:如何確保其在醫學上被安全使用?怎樣平衡其益處與風險?這些或是未來需要深入探討的問題。

(責編:楊曦、陳鍵)
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