1993年7月28日，時任國務院副總理朱镕基對中國人民銀行“關於財政部和國家經貿委共同組建中國經濟技術投資擔保公司的請示”做出批示，同意中投保公司特例試辦。同年12月4日，中投保公司經國家工商行政管理總局注冊成立，注冊資本金為5億元人民幣。公司作為非銀行金融機構，業務接受中國人民銀行的領導、管理、協調、監督和稽核。

1999年1月2日，按照中央有關文件精神，中投保公司與財政部脫鉤，移交中央大型企業工委管理，公司不再具有金融機構性質。同年12月，中央撤銷大型企業工作委員會，成立中央企業工作委員會，公司由中央企工委管理。

2003年3月21日，國務院國有資產監督管理委員會成立。作為中央直屬重點國有企業，中投保公司劃歸國務院國資委管理。

2006年10月，經國務院批准，中投保公司整體並入國家開發投資公司。同年12月，國家開發投資公司向公司注入資本金23.355億元，中投保公司注冊資本變更為30億元人民幣。依據《公司法》，公司設立董事會和監事會。

2010年7月，中投保公司完成增資改制工作，引入中外六家投資者，注冊資本由30億元增加到35.2億元人民幣。

2011年3月31日，中投保公司獲得北京市金融工作局頒發的融資性擔保機構經營許可証，証書編碼為京A000001。

2012年9月，中投保公司完成注冊資本轉增工作，轉增后公司注冊資本變更為45億元人民幣。

2013年10月，中投保公司更名為“中國投融資擔保有限公司”。

2015年8月，完成股份制改造，中投保公司更名為“中國投融資擔保股份有限公司”。同年12月，中投保公司挂牌新三板。